Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms