Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPDC1A2A3K4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms