Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLRN2A0PK11 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
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