Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms