Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 GART-214ENST00000476524 806 ntTSL 28.36□□□□□ -1.075e-13■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 GART-201ENST00000361093 2149 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.075e-13■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 GART-202ENST00000366093 805 ntTSL 38.11□□□□□ -1.115e-13■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 GART-206ENST00000424203 3571 ntTSL 1 (best)7.79□□□□□ -1.165e-13■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.215e-13■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 GART-207ENST00000426819 837 ntTSL 57.4□□□□□ -1.225e-13■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 GART-218ENST00000497313 457 ntTSL 37.4□□□□□ -1.225e-13■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 ACSL3-211ENST00000542810 428 ntTSL 27.14□□□□□ -1.275e-6■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.495e-13■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 RPL7L1-203ENST00000459829 801 ntTSL 25.56□□□□□ -1.525e-6■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 NUP214-224ENST00000530863 560 ntTSL 54.49□□□□□ -1.695e-6■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 GINS1-202ENST00000473460 541 ntTSL 22.39□□□□□ -2.035e-6■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 TRIP6-203ENST00000429658 646 ntTSL 314.83□□□□□ -0.043e-6■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 PACS1-205ENST00000527224 3024 ntTSL 219.59■□□□□ 0.734e-10■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 ROCK2-205ENST00000460262 597 ntTSL 47.27□□□□□ -1.254e-10■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 ROCK2-208ENST00000493096 461 ntTSL 22.27□□□□□ -2.054e-10■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 PDE8A-215ENST00000561105 191 ntTSL 22.23□□□□□ -2.052e-12■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 ENTPD6-216ENST00000481322 414 ntTSL 312.3□□□□□ -0.444e-8■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 AHCY-202ENST00000468908 675 ntTSL 513.52□□□□□ -0.251e-6■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.774e-6■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.734e-6■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.184e-6■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.54e-6■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.69□□□□□ -2.38e-57■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.56■□□□□ 0.241e-323■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.47■□□□□ 0.231e-323■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 AC022816.1-201ENST00000436469 804 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.23e-24■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 ZFP90-208ENST00000569323 556 ntTSL 415.33■□□□□ 0.045e-6■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 ANPEP-203ENST00000558740 573 ntTSL 213.16□□□□□ -0.31e-8■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 NBR1-203ENST00000585505 3295 ntTSL 29□□□□□ -0.971e-8■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.355e-6■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 CCNL1-209ENST00000467081 564 ntTSL 34.67□□□□□ -1.661e-8■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 DENND5A-207ENST00000527896 604 ntTSL 33.95□□□□□ -1.781e-8■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 CCNL1-205ENST00000464575 505 ntTSL 43.18□□□□□ -1.91e-8■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 DENND5A-212ENST00000530867 529 ntTSL 23.18□□□□□ -1.91e-8■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 DENND5A-204ENST00000526523 572 ntTSL 32.7□□□□□ -1.981e-8■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 CPOX-205ENST00000515041 1030 ntTSL 223.45■■□□□ 1.343e-8■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 CPOX-204ENST00000513674 826 ntTSL 521.69■■□□□ 1.063e-8■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 PTTG1-204ENST00000519287 670 ntTSL 57.02□□□□□ -1.294e-6■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 BPTF-205ENST00000424123 8295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)5.66□□□□□ -1.51e-6■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.041e-8■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 PRSS21-208ENST00000575199 679 ntTSL 220.45■□□□□ 0.861e-8■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 PRSS21-207ENST00000574813 873 ntTSL 318.12■□□□□ 0.491e-8■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 PRSS21-210ENST00000577043 814 ntTSL 518.01■□□□□ 0.471e-8■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 PRSS21-203ENST00000570594 809 ntTSL 316.98■□□□□ 0.311e-8■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.151e-8■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 PRSS21-206ENST00000574265 860 ntTSL 312.16□□□□□ -0.461e-8■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 PRSS21-204ENST00000570629 626 ntTSL 211.96□□□□□ -0.491e-8■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 STAT5A-206ENST00000479417 553 ntTSL 311.86□□□□□ -0.511e-8■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 FDFT1-216ENST00000529521 418 ntTSL 22.94□□□□□ -1.941e-8■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 MPRIP-207ENST00000429184 914 ntTSL 515.62■□□□□ 0.091e-6■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 MPRIP-206ENST00000414263 4043 ntTSL 211.18□□□□□ -0.621e-6■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 MPRIP-208ENST00000462033 309 ntTSL 29.47□□□□□ -0.891e-6■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 MPRIP-214ENST00000579361 844 ntTSL 39.2□□□□□ -0.941e-6■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 MPRIP-211ENST00000578209 751 ntTSL 37.24□□□□□ -1.251e-6■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 APOC2-202ENST00000585786 880 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.25e-8■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.675e-8■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.742e-7■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 SLC51A-210ENST00000476129 565 ntTSL 415.04■□□□□ -04e-15■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 SFXN3-206ENST00000487721 761 ntTSL 311.71□□□□□ -0.538e-9■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 SFXN3-203ENST00000465383 549 ntTSL 28.19□□□□□ -1.18e-9■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 AKR1C1-203ENST00000442997 744 ntTSL 310.04□□□□□ -0.85e-7■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 AKR1C1-202ENST00000380872 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.025e-7■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 AKR1C1-205ENST00000477661 2637 ntTSL 57.72□□□□□ -1.175e-7■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.732e-6■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 IARS-211ENST00000490438 887 ntTSL 213.3□□□□□ -0.284e-6■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 TINAGL1-205ENST00000466998 680 ntTSL 218.04■□□□□ 0.482e-7■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.362e-7■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 POR-219ENST00000471238 600 ntTSL 316.64■□□□□ 0.252e-7■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.212e-7■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 POR-203ENST00000412521 586 ntTSL 415.04■□□□□ -02e-7■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 POR-215ENST00000453773 498 ntTSL 413.39□□□□□ -0.272e-7■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 POR-208ENST00000432753 561 ntTSL 411□□□□□ -0.652e-7■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 POR-207ENST00000426184 565 ntTSL 410.16□□□□□ -0.782e-7■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 POR-220ENST00000475509 590 ntTSL 510.11□□□□□ -0.792e-7■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 POR-204ENST00000414186 548 ntTSL 410.01□□□□□ -0.812e-7■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 FAM193B-206ENST00000506432 426 ntTSL 28.26□□□□□ -1.092e-7■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 CEP250-211ENST00000474829 356 ntTSL 34.33□□□□□ -1.722e-7■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.348e-11■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.338e-11■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.178e-11■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.28e-11■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 SON-201ENST00000300278 7477 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.428e-11■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 ALDH1A2-208ENST00000558239 664 ntTSL 411.35□□□□□ -0.598e-11■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 ALDH1A2-202ENST00000347587 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.638e-11■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 ALDH1A2-207ENST00000558231 1664 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.698e-11■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 ALDH1A2-203ENST00000430119 3049 ntTSL 210.52□□□□□ -0.738e-11■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 ALDH1A2-205ENST00000557967 577 ntTSL 49.1□□□□□ -0.958e-11■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 ALDH1A2-212ENST00000558595 484 ntTSL 39.1□□□□□ -0.958e-11■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 ALDH1A2-206ENST00000558073 581 ntTSL 48.1□□□□□ -1.118e-11■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 ALDH1A2-220ENST00000560122 562 ntTSL 57.89□□□□□ -1.158e-11■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 ALDH1A2-216ENST00000559297 542 ntTSL 46.56□□□□□ -1.368e-11■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 SON-205ENST00000421541 1151 ntTSL 1 (best)5.56□□□□□ -1.528e-11■□□□□ 8.9
EFTUD2Q15029 HBG2-203ENST00000380259 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.672e-14■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 HBG2-202ENST00000380252 694 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.82e-14■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.321e-8■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 HNRNPD-209ENST00000513584 1240 ntTSL 222.79■■□□□ 1.241e-8■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.21e-8■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.611e-8■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 HNRNPD-206ENST00000508119 735 ntTSL 28.95□□□□□ -0.981e-8■□□□□ 8.8
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