Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 IGF1R-201ENST00000268035 11803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.599e-8■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 MST1L-202ENST00000455405 3184 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.62e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 SRC-208ENST00000477475 584 ntTSL 511.18□□□□□ -0.629e-8■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PHYKPL-214ENST00000506045 731 ntTSL 511.16□□□□□ -0.622e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TCEAL4-203ENST00000425011 338 ntTSL 311.08□□□□□ -0.642e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 IGF2R-204ENST00000475834 758 ntTSL 210.9□□□□□ -0.662e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 MST1L-205ENST00000624762 3995 ntTSL 510.67□□□□□ -0.72e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TCEAL4-210ENST00000481555 401 ntTSL 210.4□□□□□ -0.742e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TMEM205-215ENST00000592952 428 ntTSL 510.34□□□□□ -0.752e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TBCK-202ENST00000361687 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.773e-21■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ZNF512-204ENST00000416005 3515 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.782e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 CHKA-207ENST00000533728 662 ntTSL 29.91□□□□□ -0.829e-8■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 UBE3C-205ENST00000470408 5197 ntTSL 29.84□□□□□ -0.832e-16■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TBCK-203ENST00000394706 3349 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.863e-21■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TMEM205-212ENST00000590482 619 ntTSL 59.66□□□□□ -0.862e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TCEAL4-212ENST00000494801 1008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.892e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TBCK-201ENST00000273980 8101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.93e-21■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ENPP1-202ENST00000459624 1633 ntTSL 1 (best)9.43□□□□□ -0.92e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 CTC1-204ENST00000578441 781 ntTSL 59.4□□□□□ -0.94e-9■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TCEAL4-202ENST00000415568 959 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.912e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 SRC-205ENST00000467556 502 ntTSL 29.33□□□□□ -0.929e-8■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 CHID1-213ENST00000528521 323 ntTSL 59.29□□□□□ -0.929e-8■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ZNF512-202ENST00000379717 3417 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.952e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TBCK-206ENST00000467183 3566 ntTSL 1 (best)9.09□□□□□ -0.953e-21■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ZNF512-201ENST00000355467 3541 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.982e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ZNF512-208ENST00000556601 3543 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.992e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ZNF512-203ENST00000413371 3703 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.012e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 SOX13-207ENST00000528591 597 ntTSL 48.65□□□□□ -1.022e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TCEAL4-213ENST00000613326 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.042e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.059e-8■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 AKIRIN1-204ENST00000531822 718 ntTSL 58.06□□□□□ -1.129e-8■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TCEAL4-207ENST00000469586 566 ntTSL 28□□□□□ -1.132e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 NCMAP-202ENST00000486262 4063 ntTSL 37.43□□□□□ -1.222e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 IGF1R-217ENST00000561049 682 ntTSL 57.34□□□□□ -1.239e-8■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PCSK6-206ENST00000558864 3868 ntTSL 26.95□□□□□ -1.32e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ZNF512-206ENST00000488055 2465 ntTSL 26.92□□□□□ -1.32e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PDXDC2P-203ENST00000529118 547 ntTSL 26.38□□□□□ -1.392e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.472e-10■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ALDH18A1-205ENST00000489386 543 ntTSL 35.69□□□□□ -1.52e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.543e-21■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.562e-10■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 UBE3C-208ENST00000497368 776 ntTSL 25.13□□□□□ -1.592e-16■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 UGP2-211ENST00000475550 4397 ntTSL 1 (best)4.87□□□□□ -1.632e-10■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 UBA5-210ENST00000489361 417 ntTSL 34.74□□□□□ -1.652e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 RPS25-205ENST00000528547 189 ntTSL 33.71□□□□□ -1.829e-8■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 CTC1-209ENST00000581729 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 33.65□□□□□ -1.834e-9■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TBCK-208ENST00000503832 865 ntTSL 53.59□□□□□ -1.833e-21■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.872e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TBCK-209ENST00000505574 282 ntTSL 43.29□□□□□ -1.883e-21■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TNS1-215ENST00000480416 335 ntTSL 22.75□□□□□ -1.972e-10■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.72□□□□□ -1.974e-9■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 CDC14B-212ENST00000484948 350 ntTSL 52.71□□□□□ -1.982e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 CTC1-207ENST00000580299 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 52.04□□□□□ -2.084e-9■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PAN2-216ENST00000550555 507 ntTSL 411.08□□□□□ -0.644e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PAN2-208ENST00000547994 2605 ntTSL 1 (best)10.82□□□□□ -0.684e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PAN2-211ENST00000549073 587 ntTSL 49□□□□□ -0.974e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 UBE2D2-204ENST00000505007 1170 ntTSL 318.05■□□□□ 0.482e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.613e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ZFP90-206ENST00000566573 545 ntTSL 425.09■■□□□ 1.613e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ZFP90-216ENST00000573685 543 ntTSL 425.09■■□□□ 1.613e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.613e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ZFP90-218ENST00000576805 648 ntTSL 317.66■□□□□ 0.423e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.343e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ZFP90-202ENST00000562156 485 ntTSL 416.81■□□□□ 0.283e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ZFP90-213ENST00000571809 650 ntTSL 415.45■□□□□ 0.063e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.033e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ZFP90-210ENST00000570884 578 ntTSL 413.37□□□□□ -0.273e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ZFP90-205ENST00000564558 4664 ntTSL 1 (best)10.86□□□□□ -0.673e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.05■□□□□ 0.323e-13■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.183e-13■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ATP1B3-205ENST00000475483 734 ntTSL 314.44□□□□□ -0.17e-13■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PILRB-212ENST00000608825 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 310.57□□□□□ -0.721e-8■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PILRB-205ENST00000438231 603 ntTSL 39.71□□□□□ -0.861e-8■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 WSB1-206ENST00000578312 692 ntTSL 414.88□□□□□ -0.032e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 WSB1-214ENST00000583742 544 ntTSL 414.88□□□□□ -0.032e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 WSB1-217ENST00000584354 544 ntTSL 214.38□□□□□ -0.112e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 WSB1-215ENST00000583786 481 ntTSL 510.98□□□□□ -0.652e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 CCDC117-206ENST00000453543 1026 ntTSL 228.51■■■□□ 2.157e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 CCDC117-204ENST00000444523 463 ntTSL 423.01■■□□□ 1.277e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PPA2-206ENST00000457404 778 ntTSL 220.31■□□□□ 0.847e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 HGS-203ENST00000570652 523 ntTSL 519.83■□□□□ 0.777e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PPA2-212ENST00000504028 596 ntTSL 518.82■□□□□ 0.67e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PPA2-215ENST00000508518 677 ntTSL 518.82■□□□□ 0.67e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PPA2-220ENST00000513649 571 ntTSL 418.82■□□□□ 0.67e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.417e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 FAM169A-206ENST00000514200 751 ntTSL 417.52■□□□□ 0.46e-13■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PPA2-217ENST00000509426 1356 ntTSL 217.14■□□□□ 0.337e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.297e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PPA2-216ENST00000509031 1177 ntTSL 1 (best)16.83■□□□□ 0.287e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PPA2-218ENST00000510015 582 ntTSL 516.8■□□□□ 0.287e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PPA2-213ENST00000505713 584 ntTSL 416.55■□□□□ 0.247e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PPA2-207ENST00000499847 631 ntTSL 216.08■□□□□ 0.167e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PPA2-209ENST00000502610 804 ntTSL 216.08■□□□□ 0.167e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PPA2-221ENST00000514209 481 ntTSL 516.08■□□□□ 0.167e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 FAM169A-205ENST00000513277 803 ntTSL 315.38■□□□□ 0.056e-13■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -07e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 HGS-210ENST00000573320 547 ntTSL 314.54□□□□□ -0.087e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.167e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.163e-33■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.197e-7■□□□□ 9.2
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