Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 PSMA6-203ENST00000553688 787 ntTSL 57.59□□□□□ -1.191e-13■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 PSMA6-207ENST00000554620 790 ntTSL 57.59□□□□□ -1.191e-13■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 PSMA6-209ENST00000554961 814 ntTSL 27.59□□□□□ -1.191e-13■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.31e-13■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.31e-13■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.391e-13■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.421e-13■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 NOP56-208ENST00000467857 735 ntTSL 29.38□□□□□ -0.915e-9■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 MAP4-212ENST00000468075 487 ntTSL 514.82□□□□□ -0.041e-8■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 ZNF69-201ENST00000340180 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.751e-8■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 SH3D21-206ENST00000508854 1134 ntTSL 59.3□□□□□ -0.921e-8■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 ZNF69-203ENST00000445911 569 ntTSL 29.01□□□□□ -0.971e-8■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 ZNF69-202ENST00000429654 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.081e-8■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 MAP4-210ENST00000439356 2743 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.091e-8■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 MAP4-206ENST00000423088 899 ntTSL 38.22□□□□□ -1.091e-8■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 ARRB1-209ENST00000532447 701 ntTSL 510.95□□□□□ -0.665e-6■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 UBAP2L-211ENST00000456325 812 ntTSL 316.23■□□□□ 0.194e-6■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 USP3-218ENST00000560202 1681 ntTSL 511.29□□□□□ -0.62e-9■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 USP3-214ENST00000559718 757 ntTSL 210.78□□□□□ -0.682e-9■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 USP3-220ENST00000561381 979 ntTSL 210.78□□□□□ -0.682e-9■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 USP3-207ENST00000558218 717 ntTSL 39.48□□□□□ -0.892e-9■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 STMN1-208ENST00000485226 449 ntTSL 26.03□□□□□ -1.442e-9■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.452e-9■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 STMN1-205ENST00000446334 665 ntTSL 25.9□□□□□ -1.462e-9■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 PSMD5-204ENST00000373920 569 ntTSL 55.27□□□□□ -1.572e-9■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 LSS-209ENST00000484808 251 ntTSL 515.86■□□□□ 0.136e-16■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 CPNE7-205ENST00000529800 519 ntTSL 59.27□□□□□ -0.931e-6■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.423e-8■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 ELF2-209ENST00000511184 1766 ntTSL 527.71■■■□□ 2.032e-6■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 ELF2-208ENST00000511006 1434 ntTSL 1 (best)20.63■□□□□ 0.892e-6■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 ZNF292-208ENST00000518845 277 ntTSL 319.67■□□□□ 0.745e-8■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.25e-8■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 ZNF292-207ENST00000496806 770 ntTSL 313.26□□□□□ -0.295e-8■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 NUSAP1-201ENST00000260359 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.765e-8■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 NUSAP1-212ENST00000560747 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.945e-8■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 NUSAP1-205ENST00000558123 1934 ntTSL 58.69□□□□□ -1.025e-8■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 NUSAP1-210ENST00000560177 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.055e-8■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 NUSAP1-209ENST00000559659 529 ntTSL 28.24□□□□□ -1.095e-8■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 NUSAP1-206ENST00000558582 546 ntTSL 58.11□□□□□ -1.115e-8■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 NUSAP1-207ENST00000559046 580 ntTSL 58.02□□□□□ -1.135e-8■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 NUSAP1-203ENST00000450592 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.165e-8■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.165e-8■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.235e-8■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.355e-8■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 PTPRH-207ENST00000588559 2636 ntTSL 220.26■□□□□ 0.835e-6■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 WDR59-211ENST00000564859 488 ntTSL 314.42□□□□□ -0.15e-8■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.085e-6■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 PI4KAP2-206ENST00000470274 2414 ntTSL 218.4■□□□□ 0.545e-6■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 PI4KAP2-213ENST00000494740 2273 ntTSL 516.15■□□□□ 0.185e-6■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 PI4KAP2-208ENST00000477296 1787 ntTSL 216.03■□□□□ 0.165e-6■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 BCR-208ENST00000466076 495 ntTSL 315.69■□□□□ 0.15e-6■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 PI4KAP2-203ENST00000462560 2553 ntTSL 1 (best)15.05■□□□□ 05e-6■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 PI4KAP2-204ENST00000463608 2816 ntTSL 514.98□□□□□ -0.015e-6■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC14.21□□□□□ -0.145e-6■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.335e-6■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 BCR-215ENST00000487968 2870 ntTSL 211.49□□□□□ -0.575e-6■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 MLLT10-208ENST00000438473 1085 ntTSL 55.1□□□□□ -1.595e-6■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 MLLT10-206ENST00000420525 538 ntTSL 32.51□□□□□ -2.015e-6■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 HGD-201ENST00000283871 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.941e-16■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 HGD-204ENST00000475447 565 ntTSL 37.26□□□□□ -1.251e-16■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 HGD-209ENST00000492108 631 ntTSL 27.24□□□□□ -1.251e-16■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 HGD-210ENST00000494453 683 ntTSL 35.4□□□□□ -1.541e-16■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 PFKP-209ENST00000460445 552 ntTSL 512.81□□□□□ -0.367e-13■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 LUC7L-216ENST00000469109 950 ntTSL 1 (best)11.96□□□□□ -0.497e-13■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 LUC7L-212ENST00000443357 833 ntTSL 26.59□□□□□ -1.357e-13■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 CPSF6-204ENST00000547486 872 ntTSL 212.43□□□□□ -0.422e-6■□□□□ 9.3
EFTUD2Q15029 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.191e-20■□□□□ 9.3
EFTUD2Q15029 SOS1-204ENST00000451331 579 ntTSL 415.82■□□□□ 0.128e-10■□□□□ 9.3
EFTUD2Q15029 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.668e-10■□□□□ 9.3
EFTUD2Q15029 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.69e-8■□□□□ 9.3
EFTUD2Q15029 SNHG7-202ENST00000416970 789 ntTSL 1 (best)23.15■■□□□ 1.39e-8■□□□□ 9.3
EFTUD2Q15029 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.279e-8■□□□□ 9.3
EFTUD2Q15029 SAFB2-205ENST00000590000 633 ntTSL 213.29□□□□□ -0.289e-8■□□□□ 9.3
EFTUD2Q15029 CARM1-210ENST00000592516 696 ntTSL 311.73□□□□□ -0.539e-8■□□□□ 9.3
EFTUD2Q15029 RAP1GAP-208ENST00000464457 409 ntTSL 37.81□□□□□ -1.169e-8■□□□□ 9.3
EFTUD2Q15029 RPS7-206ENST00000472966 556 ntTSL 1 (best)6.47□□□□□ -1.379e-8■□□□□ 9.3
EFTUD2Q15029 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.463e-24■□□□□ 9.3
EFTUD2Q15029 SERINC2-203ENST00000487207 735 ntTSL 216.15■□□□□ 0.181e-10■□□□□ 9.3
EFTUD2Q15029 AES-209ENST00000587393 1082 ntTSL 216■□□□□ 0.152e-6■□□□□ 9.3
EFTUD2Q15029 NR1H2-207ENST00000597130 894 ntTSL 316.17■□□□□ 0.183e-7■□□□□ 9.3
EFTUD2Q15029 ATP1B3-209ENST00000487199 421 ntTSL 32.59□□□□□ -1.997e-16■□□□□ 9.3
EFTUD2Q15029 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC3.29□□□□□ -1.881e-323■□□□□ 9.3
EFTUD2Q15029 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.091e-6■□□□□ 9.3
EFTUD2Q15029 YME1L1-209ENST00000613434 4127 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.721e-6■□□□□ 9.3
EFTUD2Q15029 YME1L1-203ENST00000376016 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.851e-6■□□□□ 9.3
EFTUD2Q15029 YME1L1-201ENST00000326799 3994 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.11e-6■□□□□ 9.3
EFTUD2Q15029 SLC22A31-204ENST00000568161 651 ntTSL 314.2□□□□□ -0.143e-7■□□□□ 9.3
EFTUD2Q15029 MAN2C1-228ENST00000565953 557 ntTSL 312.24□□□□□ -0.453e-14■□□□□ 9.3
EFTUD2Q15029 FMNL1-210ENST00000592006 888 ntTSL 518.01■□□□□ 0.477e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.347e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PI4KAP1-208ENST00000619742 1787 ntTSL 216.03■□□□□ 0.167e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ECT2-202ENST00000366090 734 ntTSL 315.16■□□□□ 0.027e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ECT2-207ENST00000426894 560 ntTSL 415.16■□□□□ 0.027e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 MOV10-214ENST00000490413 1370 ntTSL 213.61□□□□□ -0.237e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 MIS18BP1-201ENST00000310806 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.427e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 MOV10-207ENST00000471160 493 ntTSL 311.5□□□□□ -0.577e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 FMNL1-209ENST00000591434 580 ntTSL 410.32□□□□□ -0.767e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 MOV10-213ENST00000488160 896 ntTSL 29.33□□□□□ -0.927e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 MOV10-211ENST00000482545 380 ntTSL 59.26□□□□□ -0.937e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 MOV10-210ENST00000481711 379 ntTSL 35.63□□□□□ -1.517e-7■□□□□ 9.2
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