Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA3Q9Y6H8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms