Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARFGEF1Q9Y6D6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms