Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSX2IPQ9Y2D8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms