Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF13BQ9Y275 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms