Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y215

COLQ, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLQQ9Y215 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COLQQ9Y215 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COLQQ9Y215 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COLQQ9Y215 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COLQQ9Y215 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COLQQ9Y215 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COLQQ9Y215 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLQQ9Y215 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COLQQ9Y215 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COLQQ9Y215 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COLQQ9Y215 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COLQQ9Y215 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COLQQ9Y215 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COLQQ9Y215 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COLQQ9Y215 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COLQQ9Y215 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COLQQ9Y215 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COLQQ9Y215 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COLQQ9Y215 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COLQQ9Y215 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COLQQ9Y215 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COLQQ9Y215 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COLQQ9Y215 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COLQQ9Y215 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COLQQ9Y215 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COLQQ9Y215 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms