Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS5Q9UPZ3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPS5Q9UPZ3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms