Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms