Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTF2Q9UNY4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTF2Q9UNY4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TTF2Q9UNY4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms