Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNE0

EDAR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member EDAR, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDARQ9UNE0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EDARQ9UNE0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EDARQ9UNE0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EDARQ9UNE0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EDARQ9UNE0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EDARQ9UNE0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EDARQ9UNE0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EDARQ9UNE0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EDARQ9UNE0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EDARQ9UNE0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EDARQ9UNE0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EDARQ9UNE0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EDARQ9UNE0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EDARQ9UNE0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EDARQ9UNE0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EDARQ9UNE0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EDARQ9UNE0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EDARQ9UNE0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EDARQ9UNE0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EDARQ9UNE0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EDARQ9UNE0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EDARQ9UNE0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EDARQ9UNE0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EDARQ9UNE0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EDARQ9UNE0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms