Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms