Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PADI3Q9ULW8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
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