Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL62

TRPC5, Short transient receptor potential channel 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC5Q9UL62 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPC5Q9UL62 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPC5Q9UL62 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPC5Q9UL62 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPC5Q9UL62 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPC5Q9UL62 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPC5Q9UL62 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPC5Q9UL62 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPC5Q9UL62 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPC5Q9UL62 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPC5Q9UL62 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPC5Q9UL62 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRPC5Q9UL62 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRPC5Q9UL62 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRPC5Q9UL62 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRPC5Q9UL62 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRPC5Q9UL62 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRPC5Q9UL62 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRPC5Q9UL62 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRPC5Q9UL62 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRPC5Q9UL62 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRPC5Q9UL62 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPC5Q9UL62 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPC5Q9UL62 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPC5Q9UL62 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPC5Q9UL62 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPC5Q9UL62 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPC5Q9UL62 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPC5Q9UL62 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPC5Q9UL62 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPC5Q9UL62 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPC5Q9UL62 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPC5Q9UL62 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPC5Q9UL62 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPC5Q9UL62 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRPC5Q9UL62 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TRPC5Q9UL62 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRPC5Q9UL62 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRPC5Q9UL62 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRPC5Q9UL62 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRPC5Q9UL62 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRPC5Q9UL62 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TRPC5Q9UL62 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRPC5Q9UL62 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRPC5Q9UL62 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms