Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms