Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO3Q9UK99 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO3Q9UK99 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO3Q9UK99 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO3Q9UK99 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO3Q9UK99 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO3Q9UK99 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO3Q9UK99 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO3Q9UK99 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO3Q9UK99 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO3Q9UK99 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO3Q9UK99 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO3Q9UK99 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO3Q9UK99 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO3Q9UK99 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO3Q9UK99 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO3Q9UK99 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO3Q9UK99 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO3Q9UK99 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO3Q9UK99 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO3Q9UK99 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO3Q9UK99 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO3Q9UK99 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO3Q9UK99 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO3Q9UK99 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO3Q9UK99 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO3Q9UK99 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO3Q9UK99 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms