Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK23

NAGPA, N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAGPAQ9UK23 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAGPAQ9UK23 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAGPAQ9UK23 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAGPAQ9UK23 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NAGPAQ9UK23 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAGPAQ9UK23 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAGPAQ9UK23 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAGPAQ9UK23 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAGPAQ9UK23 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAGPAQ9UK23 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAGPAQ9UK23 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAGPAQ9UK23 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAGPAQ9UK23 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAGPAQ9UK23 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms