Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGA1Q9UJY5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms