Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms