Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OPN4Q9UHM6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms