Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms