Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
KDM5BQ9UGL1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms