Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms