Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
CLIP2Q9UDT6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms