Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN8Q9UBY8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms