Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms