Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZD8

SPG21, Maspardin, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG21Q9NZD8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPG21Q9NZD8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms