Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms