Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDAP2Q9NXN4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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