Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCM9Q9NXL9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms