Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDIT4Q9NX09 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDIT4Q9NX09 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms