Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms