Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms