Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX15Q9NRS6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms