Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO6Q9NRD1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO6Q9NRD1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms