Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CABP2Q9NPB3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms