Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNPLA8Q9NP80 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms