Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX8Q9HC52 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms