Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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