Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAS3

SLC28A3, Solute carrier family 28 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3Q9HAS3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC28A3Q9HAS3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms