Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8S5

CNTD2, Cyclin N-terminal domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD2Q9H8S5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTD2Q9H8S5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNTD2Q9H8S5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CNTD2Q9H8S5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNTD2Q9H8S5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNTD2Q9H8S5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTD2Q9H8S5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTD2Q9H8S5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTD2Q9H8S5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTD2Q9H8S5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTD2Q9H8S5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTD2Q9H8S5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTD2Q9H8S5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTD2Q9H8S5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTD2Q9H8S5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTD2Q9H8S5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTD2Q9H8S5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTD2Q9H8S5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTD2Q9H8S5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTD2Q9H8S5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTD2Q9H8S5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTD2Q9H8S5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTD2Q9H8S5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTD2Q9H8S5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTD2Q9H8S5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTD2Q9H8S5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms