Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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