Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPF2Q9H7B2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPF2Q9H7B2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPF2Q9H7B2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPF2Q9H7B2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPF2Q9H7B2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPF2Q9H7B2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPF2Q9H7B2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPF2Q9H7B2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPF2Q9H7B2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPF2Q9H7B2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPF2Q9H7B2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPF2Q9H7B2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPF2Q9H7B2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms