Protein–RNA interactions for Protein: Q9H300

PARL, Presenilins-associated rhomboid-like protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARLQ9H300 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PARLQ9H300 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms