Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms